Höchstes Organ der SALUS gGmbH ist die Gesellschafterversammlung, der u.a. die Beschlussfassungen über die Jahresabschlüsse, über die Bestellung des Abschlussprüfers sowie über Änderungen im Gesellschaftervertrag obliegen. Die Wahrnehmung der Gesellschafterrechte des Landes Sachsen-Anhalt erfolgt durch den Minister für Gesundheit und Soziales, Norbert Bischoff (SPD). Die Gesellschafterversammlung tritt in der Regel einmal im Jahr zusammen.